الميلاتونين هو هرمون أميني تنتجه بشكل رئيسي الغدة الصنوبرية لدى الثدييات والبشر. الغدة الصنوبرية البشرية هي نسيج حبيبي من الفاصوليا متصل بالجدار الخلفي للبطين الثالث. كما تم الإبلاغ عن أن شبكية العين والغدد الدمعية الملحقة بالثدييات يمكن أن تنتج أيضًا كمية صغيرة من الميلاتونين. يمكن أيضًا تصنيع الميلاتونين في عيون ودماغ وجلد بعض الحيوانات المحبة للحرارة (مثل الضفادع) وبعض الطحالب.